Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx3P81067 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx3P81067 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx3P81067 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx3P81067 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx3P81067 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx3P81067 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx3P81067 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx3P81067 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms