Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ldb1P70662 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ldb1P70662 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms