Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ErfP70459 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ErfP70459 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ErfP70459 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ErfP70459 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ErfP70459 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ErfP70459 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ErfP70459 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ErfP70459 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ErfP70459 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ErfP70459 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ErfP70459 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ErfP70459 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ErfP70459 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ErfP70459 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ErfP70459 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ErfP70459 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ErfP70459 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ErfP70459 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ErfP70459 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ErfP70459 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ErfP70459 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ErfP70459 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ErfP70459 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ErfP70459 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ErfP70459 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ErfP70459 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ErfP70459 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ErfP70459 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms