Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubb4bP68372 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms