Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cplx1P63040 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cplx1P63040 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms