Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl8P62918 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl8P62918 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl8P62918 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl8P62918 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl8P62918 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl8P62918 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl8P62918 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms