Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl30P62889 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms