Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpd1P62315 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpd1P62315 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms