Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vbp1P61759 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms