Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnd3P61588 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms