Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2kP61087 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms