Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims4P60191 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims4P60191 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms