Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp25P57080 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp25P57080 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp25P57080 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp25P57080 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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