Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc10P56960 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms