Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms