Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CdaP56389 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CdaP56389 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CdaP56389 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CdaP56389 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CdaP56389 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CdaP56389 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CdaP56389 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CdaP56389 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CdaP56389 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CdaP56389 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CdaP56389 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CdaP56389 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CdaP56389 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CdaP56389 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CdaP56389 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CdaP56389 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CdaP56389 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CdaP56389 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CdaP56389 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CdaP56389 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CdaP56389 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CdaP56389 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CdaP56389 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CdaP56389 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CdaP56389 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CdaP56389 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CdaP56389 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CdaP56389 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms