Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms