Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms