Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acod1P54987 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Acod1P54987 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms