Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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