Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa8P50706 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms