Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms