Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms