Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc2P43407 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms