Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgfrP43117 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms