Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clec3bP43025 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec3bP43025 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec3bP43025 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec3bP43025 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec3bP43025 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec3bP43025 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec3bP43025 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec3bP43025 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec3bP43025 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec3bP43025 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clec3bP43025 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms