Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx3P42581 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms