Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac1P41539 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tac1P41539 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tac1P41539 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tac1P41539 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms