Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddit3P35639 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms