Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hes1P35428 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hes1P35428 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms