Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TpoP35419 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TpoP35419 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TpoP35419 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TpoP35419 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TpoP35419 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TpoP35419 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TpoP35419 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TpoP35419 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TpoP35419 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TpoP35419 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TpoP35419 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TpoP35419 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TpoP35419 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TpoP35419 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TpoP35419 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TpoP35419 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TpoP35419 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TpoP35419 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TpoP35419 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TpoP35419 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TpoP35419 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TpoP35419 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TpoP35419 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TpoP35419 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TpoP35419 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TpoP35419 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TpoP35419 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TpoP35419 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TpoP35419 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TpoP35419 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TpoP35419 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TpoP35419 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TpoP35419 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.5 ms