Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msr1P30204 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msr1P30204 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msr1P30204 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msr1P30204 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msr1P30204 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms