Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf1P28659 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Celf1P28659 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf1P28659 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf1P28659 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf1P28659 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf1P28659 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Celf1P28659 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf1P28659 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf1P28659 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf1P28659 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms