Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms