Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col2a1P28481 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms