Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjb3P28231 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb3P28231 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms