Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkchP23298 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkchP23298 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkchP23298 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkchP23298 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms