Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmnb2P21619 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb2P21619 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms