Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcb1aP21447 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcb1aP21447 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms