Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnc1P19123 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms