Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc1P18828 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms