Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18530 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18530 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18530 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18530 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18530 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18530 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18530 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18530 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18530 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18530 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18530 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18530 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18530 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18530 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18530 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18530 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms