Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CnpP16330 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CnpP16330 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CnpP16330 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CnpP16330 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CnpP16330 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CnpP16330 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CnpP16330 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CnpP16330 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CnpP16330 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CnpP16330 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CnpP16330 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CnpP16330 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CnpP16330 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CnpP16330 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CnpP16330 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CnpP16330 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CnpP16330 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CnpP16330 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CnpP16330 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CnpP16330 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CnpP16330 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CnpP16330 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CnpP16330 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CnpP16330 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CnpP16330 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CnpP16330 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CnpP16330 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CnpP16330 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CnpP16330 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CnpP16330 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CnpP16330 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CnpP16330 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CnpP16330 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CnpP16330 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CnpP16330 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CnpP16330 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CnpP16330 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CnpP16330 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CnpP16330 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CnpP16330 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CnpP16330 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CnpP16330 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CnpP16330 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CnpP16330 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CnpP16330 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CnpP16330 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CnpP16330 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CnpP16330 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CnpP16330 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CnpP16330 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CnpP16330 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CnpP16330 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CnpP16330 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CnpP16330 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CnpP16330 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CnpP16330 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CnpP16330 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CnpP16330 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CnpP16330 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CnpP16330 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CnpP16330 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CnpP16330 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CnpP16330 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CnpP16330 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CnpP16330 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CnpP16330 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CnpP16330 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CnpP16330 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CnpP16330 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CnpP16330 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CnpP16330 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CnpP16330 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CnpP16330 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CnpP16330 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CnpP16330 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CnpP16330 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CnpP16330 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms