Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rag1P15919 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rag1P15919 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rag1P15919 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rag1P15919 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rag1P15919 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms