Protein–RNA interactions for Protein: P15530

Cd79b, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd79bP15530 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd79bP15530 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd79bP15530 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms