Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh2P15116 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdh2P15116 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms