Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcl1P12850 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl1P12850 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms