Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PolP10400 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PolP10400 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PolP10400 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PolP10400 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PolP10400 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PolP10400 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PolP10400 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PolP10400 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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