Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb2P0C1T1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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