Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc9P09633 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms